Viver no mar, proteger o mar, navegar pelo mar… Elas são as Sereias Azuis! Há cerca de 100 anos, uma grande área do Japão acabou submersa devido a uma mudança nas placas tectônicas. Para preservar o território nipônico, foram surgindo uma após a outra as Cidades Costeiras, que mais tarde acabaram se tornando Cidades Marinhas, e junto da expansão das rotas marítimas que as conectavam surgiu a necessidade de uma equipe especializada para proteger os mares. Ao mesmo tempo, trabalhos marítimos se tornaram cada vez mais populares entre as mulheres. Assim, se tornar uma Sereia Azul virou o sonho de qualquer garota. Agora, as amigas de infância Akeno Misaki e Moeka China se matriculam na escola marinha de ensino médio Yokosuka, compartilhando com outras tantas meninas o sonho de se tornar uma Sereia Azul!