Quando o nível de acidentes de trabalho começam a crescer em torno de Tokyo Bay, detetives da polícia Kusumi e Hata são designados para investigar. O que eles descobrem leva a uma série de fatos emcobertos do governo, conspiração sobre uma nova arma biológica chamada WXIII-Wasted Thirteen e uma tragédia. A única esperança de parar esta ameaça é cooperar com os militares e levar WXIII a um confronto com os trabalhos de Veículos Especiais Divisão 2.