A Academia Uchihama tem recebido um número crescente de alunos e, como resultado disso, um novo prédio acabou de ser construído. Antes de fazerem a mudança a escola decide realizar um último festival de clubes no antigo prédio, no qual todos decidem dar o seu melhor para que ele faça sucesso. Nisso, há o protagonista Akiyama Sou, que é membro do Clube de Astronomia, famoso por resolver vários problemas no lugar do conselho estudantil. Em certo dia, Akiyama fica até mais tarde na escola por ter permanecido em repouso na enfermaria devido a um pequeno acidente; de repente, é sentido um abalo no local, e ao se dirigir para onde ele parecia ter começado Akiyama encontra uma misteriosa garota, nua, que dá a entender que lhe conhece. No dia seguinte essa mesma garota, chamada Yui Furukawa, visita o Clube de Astronomia querendo se juntar a eles, ao mesmo tempo que eventos estranhos se passam no antigo prédio da escola.