Num futuro distante, devido a uma guerra interplanetária que continua há séculos, as civilizações foram arruinadas. Os humanos perderam tudo, e apenas 1/5 da população sobreviveu. Diz-se que os pseudo-humanos, “The Third”, apareceram depois da guerra. Eles possuem pupilas vermelhas a que chamam de “Olhos Espaciais”. Usando-os, eles conseguem controlar sistemas de computadores e até dominar o mundo através dos seus poderes superiores. Honoka é uma garota de muitos ofícios, e aceita qualquer ordem exceto para matar. Um dia, ela encontra o jovem Ikus no deserto. Ao aceitar a ordem dele, dá início à sua grande aventura.