O fotógrafo freelancer Minagami Hayato volta à sua cidade natal de Ootomo para investigar boatos de um homem que usa uma máscara de caveira para cometer assassinatos. Quando chega na cidade, descobre uma ligação entre as vítimas e uma empresa local farmacêutica, uma nova seita religiosa e estranhas criaturas metade humana, metade animal. Com um jovem fotógrafo, ele decide descobrir quem é realmente o Skull Man.