A história se passa numa ilha, onde um “Sistema Fractale” está começando a desmoronar. Um dia, Clain encontra uma garota machucada chamada Phryne, perto de um penhasco. Ela desaparece deixando um broche. Clain começa uma aventura com uma garota chamada Nessa à procura de Phryne e descobre segredos sobre o Sistema Fractale.