D.C. II ocorre no ano de 2055, 53 anos depois da primeira série, voltando novamente no Hatsunejima. A história segue o final com que o protagonista namora a Asakura Nemu, e embora as heroínas sejam todas novas, a maioria delas estão com o sobrenome das garotas do anime passado, tendo uma grande ligação com o anime D.C.S.S. Dessa vez, ele conta o romance do protagonista Sakurai Yoshiyuki com as irmãs Asakura Otome e Asakura Yume, que moram do lado da sua casa e cresceram juntos como se fosse uma família.
