Em seu laboratório, o cientista professor Utonium tentou fazer uma fórmula para criar as garotinhas perfeitas, acrescentou açúcar, tempero e tudo que há de bom, mas acidentalmente derrubou uma dose do poderoso “Elemento X” causando numa explosão que deu vida às Meninas Super Poderosas. Florzinha, Lindinha e Docinho usam seus super poderes para combater o crime e as forças do mau que ameaçam a cidade de Townsville onde elas residem com seu pai, o professor. A cidade é dirigida pelo Prefeito e sempre que ele encontra qualquer problema utiliza a linha especial para chamar as Meninas Super Poderosas para resolverem, sejam problemas grandes ou pequenos. Os vilões mais problemáticos no enredo são o Macaco Louco, “Ele”, Fuzzy Confusão, Gangue Gangrena, Princesa e Trio Ameba.