A história começa em Tóquio, quando ocorre um mau funcionamento da rede em grande escala. Taichi está se preparando para o acampamento de verão, quando o incidente acontece. A mãe de Taichi e sua irmã mais nova Hikari ficam presas em um trem que não para de se mover, e Taichi vai a Shibuya para ajudá-las. No entanto, a caminho de lá, ele encontra um estranho fenômeno que o leva ao mundo digital junto com os outros Digi-Escolhidos.
