Depois de serem enviados para investigar o desaparecimento alarmante de quatro ninjas com limites de linhagem de diferentes países, Kakashi Hatake, Naruto Uzumaki, Sakura Haruno e Sai descobrem com sucesso seu paradeiro e informam o Hokage. Inesperadamente, os arranjos posteriores de Tsunade desmoronam quando Hiruko & mdash; o cérebro por trás do incidente e também um ex-ninja de Konohagakure obcecado pelo poder & mdash; parece anunciar que absorveu os ninjas desaparecidos & # 039; habilidades únicas. À beira de se tornar invencível, ele busca mais um limite de linhagem antes de iniciar uma guerra total para dominar o mundo.

Como as conexões anteriores de Konohagakure com Hiruko levantam suspeitas entre as nações sobre seu envolvimento no caso, Tsunade recebe um ultimato para resolver a crise. Sem outra escolha, ela decide seguir o exemplo de Kakashi depois que ele apresenta um esquema ousado, mas salutar, uma proposta que pode mandá-lo para a morte certa. No entanto, Naruto se opõe a tal plano! Apesar da decisão do Hokage, ele está determinado a salvar a vida de seu professor, mesmo que isso signifique lutar contra amigos e inimigos.