Reina Aharen, uma estudante pequena e fofa com uma voz calma, é muito ruim em determinar distância e espaço pessoal. Às vezes ela está a centímetros do seu rosto, e outras vezes, milhas demais! O único que tenta entender suas travessuras é Raidou Matsuboshi, que está sentado ao lado dela na aula. Ele tem um rosto ameaçador, mas na realidade, ele é um garoto gentil com uma imaginação que pode correr solta às vezes. Aharen-san wa Hakarenai segue o par peculiar enquanto sua estranha amizade começa a florescer quando Raidou pega a borracha de Aharen para ela. Ela interpreta mal o gesto dele e agora acredita que eles são melhores amigos, mostrando como as coisas mais simples podem ser o mais complicado dos desafios para eles.