Depois de refletir sobre o estado atual do futebol japonês, a Associação Japonesa de Futebol decide contratar o enigmático e excêntrico treinador Jinpachi Ego para realizar seu sonho de vencer a Copa do Mundo. Acreditando que o Japão não tem um atacante egoísta com fome de gols, Jinpachi inicia o Blue Lock - uma instalação semelhante a uma prisão onde trezentos atacantes talentosos de escolas de ensino médio de todo o Japão estão isolados e colocados uns contra os outros. O único sobrevivente do Blue Lock ganhará o direito de se tornar o atacante da equipe nacional, e aqueles que forem derrotados serão proibidos de se juntar à equipe para sempre. Selecionado para se juntar a este projeto arriscado está Yoichi Isagi, um atacante que não conseguiu trazer seu time de futebol do ensino médio para o torneio nacional. Depois de escolher passar para um companheiro de equipe que errou em vez de marcar sozinho, ele não pôde deixar de se perguntar se os resultados teriam sido diferentes se ele fosse mais egoísta. Usando esta oportunidade de ouro dada pelo Blue Lock Project, Yoichi pretende esclarecer suas dúvidas e perseguir seu desejo final - se tornar o maior atacante do mundo e levar o Japão à glória da Copa do Mundo.