Sete anos após a humanidade ter sido devastada por um grande desastre, um farol de ciência e prosperidade surge na cidade de Kamitsubaki. Mas, espreitando em suas sombras, estão os Tesseractor, monstros nascidos da escuridão humana. Somente as Witchling, cinco garotas com vozes que dominam a magia, os enfrentam. A cada nota, elas lutam, não apenas para proteger a paz da cidade, mas para curar um mundo destruído.
