Go! Princesa PreCure é definido em um embarque escola secundária, chamado Noble Gakuen (Noble Academy). O protagonista Haruka Haruno é um estudante de 13 anos de idade, primeiro ano. Seu grande sonho é ser uma princesa um dia, porque ela tem admirado uma princesa no livro foto que ela tem mantido desde a infância. Um dia, ela se transforma em Cure Flora com "Dress Up Key", que o príncipe Kanata of Hope Unido deu a ela como um amuleto de boa sorte quando ela era pequena. Em seguida, ela também encontra outras meninas Precure em sua escola, 14-year-old Minami Kaidou como Cure Sereia e 13-year-old Kirara Amanogawa como Cure Twinkle. Como a equipe Princesa PreCure, com duas fadas Pafu e Aroma, eles decidem lutar contra a bruxa escuro Disupia (ou desespero) que odeia todos os sonhos do mundo e quer transformá-los ao desespero.