O anime conta a história de uma garota solitária do ensino médio chamada Momo, que frequenta uma escola secundária na cidade de Sorasaki. Sem conhecimento que as pessoas saibam, Momo é um agente que trabalha para a agência de inteligência privada Tsukikage, que tem a missão de protege a cidade e seu povo. Sob a tutela de Yuki, ela e seus amigos mantêm a paz na cidade.