Shinjiro Hayata, filho de Shin Hayata, que foi o primeiro Ultraman, tem um poder natural especial. Um dia, Shinjiro é atacado por inimigos desconhecidos. Ultraman salvou o dia, e se desmascarou para mostrar a Shinjiro que era seu pai. Usando uma armadura de Ultraman feita pelo Sr. Ide, antigo membro da Patrulha Científica, Shinjiro descarta a manopla e ajuda seu pai. Assim, a verdadeira batalha começa.
