Em 922 L.C., as pessoas enfrentam uma súbita crise. Em Tetra Heaven, a terra das lendas, uma centena de anos de guerra chega ao fim. Os deuses perdem a guerra e buscam um novo lugar para viver, e encontram Septpia, o mundo humano, que eles atacam. Os Logicalistas ligados ao ALCA, uma agência policial especial cujo dever era proteger as cidades de ataques de forasteiros (anjos), foram obrigados a agir em defesas das cidades, querendo ou não. E, dependendo de suas habilidades, Logicalistas podiam entrar em transe com deusas do outro mundo para ficar em campo de batalha. Um civil comum chamado Yoshichika Tsurugi, que tinha uma vida tranquila e sem nenhum Logic com sua família, é pego em um ataque e se abriga com outros civis. Ele então conhece a bela deusa Athena, que tem em mãos o Logic que faltava a ele. Agora os dois encontram seu destino.